After War（A.W.）15年，舞台在人类和地球受到毁灭性破坏的大战──第7次宇宙战争后荒废的地球。由于战争成为孤儿的主角卡洛特以回收和夺取MS为生计。一天受到委托，内容是希望夺回被绑架到菲利丁战舰上的少女蒂法。对蒂法一见钟情的卡洛特，因为蒂法见到委托人时的胆怯模样而带着她一起逃走。在蒂法的引导下，卡洛特找到了传说的MS“高达 X”。2人历经几番曲折，和菲利丁战舰舰长贾米尔一起踏上旅程寻找被称为“Newtype”的人们。
Dark Kindom篇月野兔是一个有点迷糊的爱哭鬼，同时也是活泼开朗的十番中学初二学生。有一天，她在偶遇一只额头长有月牙印的黑猫“露娜”后，竟变身成一个代表爱与正义力量的水手服美少女战士“ 水手月亮”。作为正义的战士，小兔肩负一个使命，那就是跟战士伙伴们一起找出幻之银水晶，来保护传说中的公主。与此同时，黑暗王国的“贝利尔女王 ”也开始了自己的邪恶计划。她为了得到蕴藏着巨大能量的银水晶复活美达利亚女王，把手下派到小兔居住的城市，不断挑起怪异的事件。小兔和其他的战士伙伴究竟能不能找到幻之银水晶，
